Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms