Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

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Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn3Q9ERG2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn3Q9ERG2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn3Q9ERG2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn3Q9ERG2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn3Q9ERG2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn3Q9ERG2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn3Q9ERG2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn3Q9ERG2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Strn3Q9ERG2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strn3Q9ERG2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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