Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfcp2Q9ERA0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms