Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx12Q9ER00 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx12Q9ER00 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms