Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Swt1Q9DBQ9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Swt1Q9DBQ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms