Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rsph3bQ9DA80 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph3bQ9DA80 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3bQ9DA80 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms