Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Subh2bvQ9D9Z7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Subh2bvQ9D9Z7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms