Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlirpQ9D8T7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SlirpQ9D8T7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms