Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D8L0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8L0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms