Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MsraQ9D6Y7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MsraQ9D6Y7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MsraQ9D6Y7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms