Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931423N10RikQ9D4J9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms