Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UvssaQ9D479 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UvssaQ9D479 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 276 ms