Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
5430402E10RikQ9D3N5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5430402E10RikQ9D3N5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
5430402E10RikQ9D3N5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
5430402E10RikQ9D3N5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
5430402E10RikQ9D3N5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
5430402E10RikQ9D3N5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms