Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan11Q9D1D1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.7 ms