Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa9Q9CZN4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms