Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc17Q9CXD9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Lrrc17Q9CXD9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Lrrc17Q9CXD9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Lrrc17Q9CXD9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Lrrc17Q9CXD9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Lrrc17Q9CXD9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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Lrrc17Q9CXD9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Lrrc17Q9CXD9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Lrrc17Q9CXD9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Lrrc17Q9CXD9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc17Q9CXD9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Lrrc17Q9CXD9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Lrrc17Q9CXD9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Lrrc17Q9CXD9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Lrrc17Q9CXD9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Lrrc17Q9CXD9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Lrrc17Q9CXD9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Lrrc17Q9CXD9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms