Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp23Q9CX11 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Utp23Q9CX11 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms