Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prkrip1Q9CWV6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkrip1Q9CWV6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms