Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhobtb3Q9CTN4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms