Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CQC3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9CQC3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQC3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CQC3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQC3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQC3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms