Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHCBP1LQ9BZQ2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHCBP1LQ9BZQ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms