Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMCQ9BYG8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GSDMCQ9BYG8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms