Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC3Q9BY71 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC3Q9BY71 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms