Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL25A1Q9BXS0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL25A1Q9BXS0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL25A1Q9BXS0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL25A1Q9BXS0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms