Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRA6Q9BX79 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRA6Q9BX79 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms