Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80bQ99PT3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80bQ99PT3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ino80bQ99PT3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ino80bQ99PT3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ino80bQ99PT3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms