Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rrbp1Q99PL5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rrbp1Q99PL5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rrbp1Q99PL5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Rrbp1Q99PL5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms