Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GpnmbQ99P91 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GpnmbQ99P91 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms