Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BrapQ99MP8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BrapQ99MP8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BrapQ99MP8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms