Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdpd3Q99LY2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms