Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Smtnl1Q99LM3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smtnl1Q99LM3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smtnl1Q99LM3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smtnl1Q99LM3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms