Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gps1Q99LD4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gps1Q99LD4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gps1Q99LD4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms