Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ciao1Q99KN2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms