Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Reep3Q99KK1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Reep3Q99KK1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms