Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ophn1Q99J31 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ophn1Q99J31 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ophn1Q99J31 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms