Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LITAFQ99732 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms