Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9AQ99638 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms