Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNQ99608 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNQ99608 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNQ99608 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNQ99608 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNQ99608 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNQ99608 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNQ99608 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNQ99608 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNQ99608 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNQ99608 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNQ99608 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNQ99608 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNQ99608 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNQ99608 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNQ99608 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNQ99608 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNQ99608 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDNQ99608 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDNQ99608 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDNQ99608 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDNQ99608 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDNQ99608 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDNQ99608 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDNQ99608 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDNQ99608 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDNQ99608 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDNQ99608 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDNQ99608 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDNQ99608 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDNQ99608 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDNQ99608 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDNQ99608 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDNQ99608 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDNQ99608 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDNQ99608 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDNQ99608 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDNQ99608 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDNQ99608 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDNQ99608 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDNQ99608 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDNQ99608 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDNQ99608 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDNQ99608 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDNQ99608 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDNQ99608 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDNQ99608 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDNQ99608 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDNQ99608 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNQ99608 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNQ99608 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNQ99608 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNQ99608 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNQ99608 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNQ99608 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNQ99608 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNQ99608 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNQ99608 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNQ99608 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNQ99608 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNQ99608 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDNQ99608 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDNQ99608 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDNQ99608 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDNQ99608 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDNQ99608 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDNQ99608 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDNQ99608 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDNQ99608 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDNQ99608 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNQ99608 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNQ99608 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNQ99608 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNQ99608 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNQ99608 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNQ99608 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNQ99608 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNQ99608 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNQ99608 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNQ99608 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNQ99608 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNQ99608 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNQ99608 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNQ99608 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNQ99608 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNQ99608 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNQ99608 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNQ99608 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNQ99608 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDNQ99608 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDNQ99608 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDNQ99608 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDNQ99608 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDNQ99608 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDNQ99608 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDNQ99608 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDNQ99608 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDNQ99608 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDNQ99608 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NDNQ99608 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms