Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC2Q96PR1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms