Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPRD1AQ96P16 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPRD1AQ96P16 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms