Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGD4Q96M96 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms