Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C8orf48Q96LL4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C8orf48Q96LL4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms