Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
PGBD1Q96JS3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PGBD1Q96JS3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGBD1Q96JS3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms