Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VPS50Q96JG6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS50Q96JG6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms