Protein–RNA interactions for Protein: Q96I45

TMEM141, Transmembrane protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM141Q96I45 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM141Q96I45 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms