Protein–RNA interactions for Protein: Q93100

PHKB, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKBQ93100 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHKBQ93100 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHKBQ93100 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms