Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf144aQ925F3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf144aQ925F3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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