Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1Q923S6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1Q923S6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1Q923S6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Neurl1Q923S6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1Q923S6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1Q923S6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Neurl1Q923S6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Neurl1Q923S6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neurl1Q923S6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms