Protein–RNA interactions for Protein: Q923P0

Col20a1, Collagen alpha-1(XX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col20a1Q923P0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col20a1Q923P0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col20a1Q923P0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col20a1Q923P0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col20a1Q923P0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col20a1Q923P0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col20a1Q923P0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Col20a1Q923P0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col20a1Q923P0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col20a1Q923P0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col20a1Q923P0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col20a1Q923P0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms