Protein–RNA interactions for Protein: Q91WK0

Lrrfip2, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip2Q91WK0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrfip2Q91WK0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrfip2Q91WK0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrfip2Q91WK0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrfip2Q91WK0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrfip2Q91WK0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrfip2Q91WK0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrfip2Q91WK0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrfip2Q91WK0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrfip2Q91WK0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrfip2Q91WK0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrfip2Q91WK0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrfip2Q91WK0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrfip2Q91WK0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip2Q91WK0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip2Q91WK0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip2Q91WK0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip2Q91WK0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip2Q91WK0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip2Q91WK0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip2Q91WK0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrfip2Q91WK0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrfip2Q91WK0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrfip2Q91WK0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms